Aide-memoire

Bio-infomaticsで困った事の備忘録的なサムシング

自分が困った事をまとめた備忘録的なサムシング

2014-01-01から1ヶ月間の記事一覧

RPS-BLAST

ただの備忘録 blast+ 2.2.28でrps-blast用のpssmデータベースの作成 % wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/mmdb/cdd/cdd.tar.gz % tar zxfv cdd.tar.gz % ls | grep "KOG" | grep "smp" > KOG.pn KOG*.smpからtitleだけパース <code> #!/usr/env/bin perl use strict</code>…